G-quadruplex; DNA; mass spectrometry; ligand; non-covalent; structural biology
Abstract :
[en] Quadruplex RNAs are less well understood than their DNA counterparts, yet of potentially high biological relevance. The interactions of several quadruplex-binding ligands with telomeric RNA quadruplexes are reported and compared with their binding to the analogous DNA quadruplexes.
Research center :
Giga-Systems Biology and Chemical Biology - ULiège
Disciplines :
Chemistry
Author, co-author :
Collie, Gavin
Reszka, Anthony P.
Haider, Shozeb M.
Gabelica, Valérie ; Université de Liège - ULiège > Département de chimie (sciences) > GIGA-R : Laboratoire de spectrométrie de masse (L.S.M.)
Parkinson, Gary N.
Neidle, Stephen
Language :
English
Title :
Selectivity in small molecule binding to human telomeric RNA and DNA quadruplexes
Publication date :
28 December 2009
Journal title :
Chemical Communications
ISSN :
1359-7345
eISSN :
1364-548X
Publisher :
Royal Society of Chemistry, Cambridge, United Kingdom
Issue :
48
Pages :
7482-7484
Peer reviewed :
Peer Reviewed verified by ORBi
Funders :
F.R.S.-FNRS - Fonds de la Recherche Scientifique [BE]
A. Siddiqui-Jain C. L. Grand D. J. Bearss L. H. Hurley Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 11593
T.-M. Ou Y.-J. Lu C. Zhang Z.-S. Huang X.-D. Wang J.-H. Tan Y. Chen D.-L. Ma K.-Y. Wong J. C.-O. Tang A. S.-C. Chan L.-Q. Gu J. Med. Chem. 2007 50 1465
M.-K. Cheng C. Modi J. C. Cookson I. Hutchinson R. A. Heald A. J. McCarroll S. Missailidis F. Tanious W. D. Wilson J.-L. Mergny C. A. Laughton M. F. G. Stevens J. Med. Chem. 2008 51 963
A. De Cian L. Lacroix C. Douarre N. Temime-Smaali C. Trentesaux J.-F. Riou J.-L. Mergny Biochimie 2008 90 131
D. Monchaud M.-P. Teulade-Fichou Org. Biomol. Chem. 2008 6 627
T. M. Ou Y. J. Lu J. H. Tan Z. S. Huang K. Y. Wong L. Q. Gu ChemMedChem 2008 3 690
D. J. Patel A. T. Phan V. Kuryavyi Nucleic Acids Res. 2007 35 7429
S. Burge G. N. Parkinson P. Hazel A. K. Todd S. Neidle Nucleic Acids Res. 2006 34 5402
O. Kikin Z. Zappala L. D'Antonio P. S. Bagga Nucleic Acids Res. 2008 D141
S. Kumari A. Bugaut J. L. Huppert S. Balasubramanian Nat. Chem. Biol. 2007 3 218
S. Kumari A. Bugaut S. Balasubramanian Biochemistry 2008 47 12664
M. Wieland J. S. Hartig Chem. Biol. 2007 14 757
A. Arora M. Dutkiewicz V. Scaria M. Hariharan S. Maiti J. Kurreck RNA 2008 14 1290
M. J. Morris S. Basu Biochemistry 2009 48 5313
C. M. Azzalin P. Reichenbach L. Khoriauli E. Giulotto J. Lingner Science 2007 318 798
S. Schoeftner M. A. Blasco Nat. Cell Biol. 2008 10 228
B. Luke J. Lingner EMBO J. 2009 28 2503
S. Schoeftner M. A. Blasco EMBO J. 2009 28 2323
A. Randall J. D. Griffith J. Biol. Chem. 2009 284 13980
Y. Xu K. Kaminaga M. Komiyama J. Am. Chem. Soc. 2008 130 11179
Y. Xu K. Kaminaga M. Komiyama Nucleic Acids Symp. Ser. 2008 52 175
H. Martadinata A. T. Phan J. Am. Chem. Soc. 2009 131 2570
G. N. Parkinson M. P. Lee S. Neidle Nature 2002 417 876
A. Joachimi A. Benz J. S. Hartig Bioorg. Med. Chem. 2009 17 6811
G. N. Parkinson F. Cuenca S. Neidle J. Mol. Biol. 2008 381 1145
F. Cuenca O. Greciano M. Gunaratnam S. Haider D. Munnur R. Nanjunda W. D. Wilson S. Neidle Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008 18 1668
M. Gunaratnam S. Swank S. M. Haider K. Galesa A. P. Reszka M. Beltran F. Cuenca J. A. Fletcher S. Neidle J. Med. Chem. 2009 52 3774
M. Read R. J. Harrison B. Romagnoli F. A. Tanious S. H. Gowan A. P. Reszka W. D. Wilson L. R. Kelland S. Neidle Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 4844
A. M. Burger F. Dai C. M. Schultes A. P. Reszka M. J. Moore J. A. Double S. Neidle Cancer Res. 2005 65 1489
M. Gunaratnam O. Greciano C. Martins A. P. Reszka C. M. Schultes H. Morjani J. F. Riou S. Neidle Biochem. Pharmacol. 2007 74 679
N. H. Campbell G. N. Parkinson A. P. Reszka S. Neidle J. Am. Chem. Soc. 2008 130 6722
S. Paramasivan I. Rujan P. H. Bolton Methods 2007 43 324
A. T. Phan V. Kuryavyi K. N. Luu D. J. Patel Nucleic Acids Res. 2007 35 6517
A. Ambrus D. Chen J. Dai T. Bialis R. A. Jones D. Yang Nucleic Acids Res. 2006 34 2723
K. W. Lim S. Amrane S. Bouaziz W. Xu Y. Mu D. J. Patel K. N. Luu A. T. Phan J. Am. Chem. Soc. 2009 131 4301
D. Renciuk I. Kejnovská P. Skoláková K. Bednárová J. Motlová M. Vorlícková Nucleic Acids Res. 2009 37 6625
J.-L. Mergny A. T. Phan L. Lacroix FEBS Lett. 1998 435 74
P. A. Rachwal K. R. Fox Methods 2007 43 291
B. Guyen C. M. Schultes P. Hazel J. Mann S. Neidle Org. Biomol. Chem. 2004 2 981
F. Rosu V. Gabelica K. Shin-ya E. De Pauw Chem. Commun. 2003 2702
N. Smargiasso F. Rosu W. Hsia P. Colson E. S. Baker M. T. Bowers E. De Pauw V. Gabelica J. Am. Chem. Soc. 2008 130 10208
F. Rosu E. De Pauw V. Gabelica Biochimie 2008 90 1074
W. D. Cornell P. Cieplak C. I. Bayly I. R. Gould K. M. Merz Jr. D. M. Ferguson D. C. Spellmeyer T. Fox J. W. Caldwell P. A. Kollman J. Am. Chem. Soc. 1995 117 5179
J.-L. Mergny A. De Cian A. Ghelab B. Saccà L. Lacroix Nucleic Acids Res. 2005 33 81
S. M. Haider G. N. Parkinson S. Neidle J. Mol. Biol. 2003 326 117
N. H. Campbell M. Patel A. Tofa R. Ghosh G. N. Parkinson S. Neidle Biochemistry 2008 130 6722
